Page 1 of 1

unexpected 'NaN' in the CONTCAR during NEB calculation

Posted: Mon Apr 13, 2009 3:24 am
by ross
Hi everyone:
When I perform a NEB calculation,in the CONTCAR there are a lot of 'NaN',as follows(CONTCAR):
Fe: 1 Atome emty-core PP
9.72000000000000
1.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000
0.0000000000000000 1.0000000000000000 0.0000000000000000
0.0000000000000000 0.0000000000000000 1.0000000000000000
54 1
Direct
0.0289011295172956 0.0000000000000000 0.9646475252568855
0.0289011295172956 0.0000000000000000 0.3686858080764422
0.0338711448408760 0.0000000000000000 0.6666666666666643
0.9895262555693592 0.3276937195276023 0.9830075127533879
0.9895262555693592 0.3276937195276023 0.3503258205799475
0.9706674919455106 0.3444979348524170 0.6666666666666643
0.9895262555693592 0.6723062804723950 0.9830075127533879
0.9895262555693592 0.6723062804723950 0.3503258205799475
0.9706674919455106 0.6555020651475809 0.6666666666666643
0.3144265003981220 0.0000000000000000 -0.0366217616900985
0.3144265003981220 0.0000000000000000 0.3699550950234341
0.3408407100153122 0.0000000000000000 0.6666666666666643
0.3132556081820759 0.3527192607730867 0.0228133206118737
0.3132556081820759 0.3527192607730867 0.3105200127214636
0.3659531462615547 0.3609627268083228 0.6666666666666643
0.3132556081820759 0.6472807392269111 0.0228133206118737
0.3132556081820759 0.6472807392269111 0.3105200127214636
0.3659531462615547 0.6390372731916745 0.6666666666666643
0.6745844193104266 0.0000000000000000 0.0167176431874527
0.6745844193104266 0.0000000000000000 0.3166156901458824
0.6287767132578672 0.0000000000000000 0.6666666666666643
0.6828961084174632 0.3058100827732423 0.0203036477225576
0.6828961084174632 0.3058100827732423 0.3130296856107773
0.6601518262043966 0.3023214217462210 0.6666666666666643
0.6828961084174632 0.6941899172267563 0.0203036477225576
0.6828961084174632 0.6941899172267563 0.3130296856107773
0.6601518262043966 0.6976785782537758 0.6666666666666643
0.1728752185354139 0.1531082626756605 0.1666666666666643
0.1801996484703649 0.2024484529290221 0.5235080627486662
0.1801996484703649 0.2024484529290221 0.8098252705846654
0.1105214720461359 0.5000000000000000 0.1666666666666643
0.1690249141253296 0.5000000000000000 0.5086227714367142
0.1690249141253296 0.5000000000000000 0.8247105618966186
0.1728752185354139 0.8468917373243382 0.1666666666666643
0.1801996484703649 0.7975515470709754 0.5235080627486662
0.1801996484703649 0.7975515470709754 0.8098252705846654
0.4761708681157552 0.1583664941035631 0.1666666666666643
0.4939578665685808 0.1765862299935572 0.4760496079130500
0.4939578665685808 0.1765862299935572 0.8572837254202853
0.5230889522352793 0.5000000000000000 0.1666666666666643
0.5087806139003397 0.5000000000000000 0.8676154174905309
0.4761708681157552 0.8416335058964376 0.1666666666666643
0.4939578665685808 0.8234137700064424 0.4760496079130500
0.4939578665685808 0.8234137700064424 0.8572837254202853
0.8787949300504807 0.1412583471792984 0.1666666666666643
0.8276749504763388 0.1414004132480921 0.5154844113693000
0.8276749504763388 0.1414004132480921 0.8178489219640328
0.8341377677575965 0.5000000000000000 0.1666666666666643
0.7965368968490946 0.5000000000000000 0.5053181699486037
0.7965368968490946 0.5000000000000000 0.8280151633847314
0.8787949300504807 0.8587416528207001 0.1666666666666643
0.8276749504763388 0.8585995867519080 0.5154844113693000
0.8276749504763388 0.8585995867519080 0.8178489219640328
0.5087806139003397 0.5000000000000000 0.4657179158428055
0.6168210817662996 0.5000000000000000 0.6666666666666643

NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN
NaN NaN NaN

Is this a usual phenomena or incorrect, and how to solve it if it is wrong.
Thanks in advance for any advice!

Re: unexpected 'NaN' in the CONTCAR during NEB calculation

Posted: Mon Apr 13, 2009 5:28 am
by graeme
This is not a problem, it just means that the velocities of the configurations are not defined.

Re: unexpected 'NaN' in the CONTCAR during NEB calculation

Posted: Mon Apr 13, 2009 5:49 am
by ross
ok,thank you very much!